L'origine du nom Frayssinet est latine: elle vient de fraichinetto ou fraxinus (fraxi au pluriel) = bois de frêne. Cet arbre état déjà très abondant au Magdalénien (vers – 15 000 avant Jésus-Christ). Il l'est encore au Moyen-âge. Symbole de puissance chez les Grecs, il représente bien ce que voulait être Frayssinet.

Frayssinet est un très ancien village dont on retrouve encore des traces dans l'architecture de nos anciennes maisons.

En 1193, il en est fait mention dans les écrits qui nous sont parvenus. En 1183, il dépend de la paroisse de St Pierre de Marcilhac qui, attirée sans doute par les terres d'assez bon rapport de Frayssinet, y installera un prieuré en 1449 (le prieur vivait en haut du grand escalier),

En 1211, pendant la guerre des Albigeois, les seigneurs de Frayssinet, issus du démembrement de la baronnie de Gourdon (qui sera ruinée en 1310) sont des Vassal. Cette famille donnera un cardinal au début du 12^ième s, lequel sera enterré dans l'église de Frayssinet où il avait fait bâtir une chapelle en l’honneur de la Vierge. Il a même donné une somme d'argent pour marier les filles pauvres de ses terres et un legs pour les églises et hôpitaux de Frayssinet et d'autres communes environnantes.

Frayssinet subira les épidémies comme celles de peste noire de 1335, de 1348..., qui décime la moitié de la population, la guerre de 100 ans et les occupations anglaises, qui furent nombreuses. On sait qu'ils régnaient sur Frayssinet déjà en 1355, qu'en 1372, des troupes anglaises campaient à Frayssinet en attendant de se diriger vers Cahors. En 1381, elles détruisent entièrement le fort, l'église, exterminent la garnison, anéantissent les ¾ de la population comme le retrace un rapport de Guillaume de Rodorel fait au Saint-Siège. Ces Rodorel avaient reçu une part de l'héritage des Vassal (branche de Bellegarde de Vassal). Le repeuplement se fera surtout avec l'immigration de régions avoisinantes où les conditions de vie semblent pire que les nôtres comme l'Auvergne, la Corrèze, la Creuse, le Limousin, le Rouergue, le Berry, la Gascogne... De là à penser que le nom de certains de nos hameaux tels le Gascou vient de gascon, Berry du Berry....il n'y à qu'un pas.

Les anglais quitteront définitivement la région en 1444 mais en 1496, le voilà envahi par les seigneurs du voisinage. Ex: en 1512, toutes les terres appartiennent à la famille Peyronenc qui ont succédé aux Vassal, (Guillaume, Jéhan, Hélie) et ce, jusqu'à la révolution. Au 19^ième s apparaît le nom des De Vallon qui s'installent dans le château de Frayssinet à Lamostonie

1789 ne semble pas avoir beaucoup troublé la quiétude des Frayssinois, plutôt aisés, mais la révolution ne les laissent pas indifférents. Le 2 prairial (21 mai 1794), un Vassal fut condamné à mort pour être un de ceux des habitants de Frayssinet qui ^« faisaient preuve de mauvais esprit, d'incivisme, qui chômaient les jours de fête, vivaient sous l'influence de suggestions fanatiques.... ^»

Avec la création du département du Lot, le village est rattaché au canton de Saint-Germain qui dépend du district de Gourdon. Joachim Murat, 19 ans, futur Roi de Naples, Maréchal d'Empire et accessoirement beau-frère de Napoléon Bonaparte est présent à Pont de Rhodes le 22 juillet 1790 pour fêter cet événement. Frayssinet y reçoit le drapeau fédératif que la garde nationale de Paris vient de donner à la fédération du Lot.